Для нормального функционирования иммунной системы необходимо сохранение особых свойств БКК. Они должны уметь различать клетки собственного организма, т. е. «свои», и посторонние вещества и микроорганизмы, т. е. «чужие», или антигены. БКК должны определить, является элемент, с которым они встречаются, своим или чужим. Этот процесс возможен благодаря способности клеток крови к считыванию информации, которую несут на себе белковые маркеры, расположенные на наружной поверхности (мембранах) всех без исключения клеток, в том числе и самих БКК. Когда БКК сталкиваются с какой-либо клеткой или веществом, они сравнивают их маркеры со своими собственными. Если обнаруживается несовпадение маркеров, БКК атакуют «пришельцев» и призывают другие клетки подключиться к своим действиям.

Каждая клетка в человеческом организме имеет свои специфические маркеры. Особенности маркеров определяются генами 6-й хромосомы. Маркеры, относящиеся к типу ткани, называются антигенами лейкоцитов человека (АЛЧ).

При хирургической пересадке тканей или органов от одного человека другому стараются, по возможности, обеспечить максимальное соответствие типа ткани донора и реципиента, чтобы предотвратить реакции иммунной системы последнего по отторжению трансплантированной ткани, если она может быть принята за чужеродную.